Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkcaP20444 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PrkcaP20444 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms