Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TP20293 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TP20293 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TP20293 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TP20293 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TP20293 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TP20293 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TP20293 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TP20293 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TP20293 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP20293 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP20293 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP20293 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP20293 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP20293 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP20293 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP20293 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP20293 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP20293 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP20293 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP20293 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP20293 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP20293 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP20293 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP20293 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP20293 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP20293 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP20293 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP20293 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TP20293 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP20293 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP20293 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP20293 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP20293 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP20293 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP20293 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP20293 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP20293 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP20293 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP20293 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TP20293 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP20293 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP20293 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP20293 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP20293 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP20293 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP20293 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TP20293 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP20293 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP20293 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP20293 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP20293 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP20293 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP20293 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP20293 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP20293 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP20293 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP20293 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP20293 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP20293 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TP20293 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TP20293 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TP20293 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TP20293 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TP20293 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TP20293 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TP20293 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TP20293 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TP20293 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TP20293 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TP20293 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TP20293 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TP20293 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TP20293 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TP20293 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TP20293 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TP20293 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TP20293 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TP20293 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TP20293 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TP20293 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TP20293 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TP20293 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TP20293 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TP20293 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TP20293 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TP20293 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TP20293 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TP20293 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TP20293 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TP20293 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TP20293 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TP20293 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TP20293 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TP20293 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TP20293 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TP20293 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TP20293 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TP20293 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TP20293 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms