Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VimP20152 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VimP20152 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VimP20152 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VimP20152 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VimP20152 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VimP20152 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VimP20152 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VimP20152 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VimP20152 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VimP20152 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VimP20152 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VimP20152 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VimP20152 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VimP20152 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VimP20152 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VimP20152 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VimP20152 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VimP20152 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VimP20152 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VimP20152 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VimP20152 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VimP20152 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VimP20152 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VimP20152 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VimP20152 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VimP20152 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VimP20152 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VimP20152 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VimP20152 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VimP20152 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VimP20152 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VimP20152 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VimP20152 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VimP20152 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VimP20152 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VimP20152 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VimP20152 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VimP20152 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VimP20152 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VimP20152 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VimP20152 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VimP20152 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VimP20152 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VimP20152 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VimP20152 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VimP20152 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VimP20152 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VimP20152 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VimP20152 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VimP20152 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VimP20152 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VimP20152 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VimP20152 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VimP20152 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VimP20152 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VimP20152 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VimP20152 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VimP20152 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VimP20152 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VimP20152 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VimP20152 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VimP20152 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VimP20152 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VimP20152 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VimP20152 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VimP20152 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VimP20152 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VimP20152 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VimP20152 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VimP20152 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VimP20152 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VimP20152 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VimP20152 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VimP20152 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VimP20152 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VimP20152 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VimP20152 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VimP20152 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VimP20152 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VimP20152 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VimP20152 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VimP20152 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VimP20152 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VimP20152 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VimP20152 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VimP20152 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VimP20152 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VimP20152 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VimP20152 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VimP20152 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VimP20152 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VimP20152 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VimP20152 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VimP20152 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VimP20152 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VimP20152 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VimP20152 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VimP20152 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VimP20152 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms