Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PdgfaP20033 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PdgfaP20033 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms