Protein–RNA interactions for Protein: P19221

F2, Prothrombin, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P19221 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F2P19221 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F2P19221 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F2P19221 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
F2P19221 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
F2P19221 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
F2P19221 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F2P19221 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F2P19221 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F2P19221 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
F2P19221 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F2P19221 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F2P19221 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
F2P19221 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
F2P19221 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F2P19221 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
F2P19221 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F2P19221 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
F2P19221 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F2P19221 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
F2P19221 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
F2P19221 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F2P19221 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F2P19221 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F2P19221 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F2P19221 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
F2P19221 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F2P19221 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F2P19221 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
F2P19221 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F2P19221 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
F2P19221 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F2P19221 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F2P19221 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F2P19221 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
F2P19221 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F2P19221 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
F2P19221 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F2P19221 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
F2P19221 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
F2P19221 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F2P19221 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F2P19221 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F2P19221 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F2P19221 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
F2P19221 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F2P19221 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F2P19221 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F2P19221 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F2P19221 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
F2P19221 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F2P19221 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F2P19221 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F2P19221 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F2P19221 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
F2P19221 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F2P19221 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F2P19221 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
F2P19221 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
F2P19221 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F2P19221 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F2P19221 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
F2P19221 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F2P19221 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F2P19221 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F2P19221 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F2P19221 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F2P19221 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F2P19221 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
F2P19221 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
F2P19221 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
F2P19221 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
F2P19221 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
F2P19221 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
F2P19221 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
F2P19221 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
F2P19221 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
F2P19221 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
F2P19221 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
F2P19221 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
F2P19221 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
F2P19221 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
F2P19221 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
F2P19221 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
F2P19221 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
F2P19221 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
F2P19221 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
F2P19221 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
F2P19221 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
F2P19221 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
F2P19221 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
F2P19221 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
F2P19221 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
F2P19221 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
F2P19221 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
F2P19221 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
F2P19221 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
F2P19221 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
F2P19221 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
F2P19221 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms