Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc1P18828 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc1P18828 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc1P18828 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc1P18828 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms