Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18529 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18529 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18529 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18529 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18529 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18529 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18529 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P18529 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18529 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18529 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18529 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18529 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18529 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18529 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18529 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18529 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18529 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18529 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18529 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18529 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18529 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18529 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18529 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18529 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18529 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18529 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18529 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18529 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18529 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18529 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18529 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18529 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18529 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18529 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18529 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18529 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P18529 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18529 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18529 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18529 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18529 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18529 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18529 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18529 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P18529 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18529 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18529 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18529 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18529 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18529 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18529 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18529 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18529 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18529 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18529 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18529 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18529 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P18529 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18529 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18529 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18529 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P18529 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18529 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18529 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18529 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18529 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18529 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P18529 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
P18529 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P18529 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P18529 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
P18529 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18529 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18529 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18529 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18529 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P18529 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms