Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ass1P16460 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ass1P16460 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ass1P16460 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ass1P16460 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ass1P16460 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ass1P16460 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ass1P16460 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ass1P16460 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ass1P16460 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ass1P16460 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ass1P16460 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ass1P16460 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ass1P16460 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ass1P16460 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ass1P16460 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ass1P16460 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ass1P16460 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ass1P16460 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ass1P16460 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ass1P16460 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ass1P16460 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ass1P16460 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ass1P16460 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ass1P16460 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ass1P16460 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ass1P16460 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ass1P16460 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ass1P16460 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ass1P16460 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ass1P16460 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ass1P16460 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ass1P16460 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ass1P16460 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ass1P16460 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ass1P16460 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ass1P16460 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ass1P16460 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ass1P16460 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ass1P16460 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ass1P16460 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ass1P16460 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ass1P16460 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ass1P16460 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ass1P16460 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ass1P16460 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ass1P16460 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ass1P16460 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ass1P16460 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ass1P16460 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ass1P16460 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ass1P16460 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ass1P16460 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ass1P16460 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ass1P16460 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ass1P16460 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ass1P16460 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ass1P16460 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ass1P16460 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ass1P16460 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ass1P16460 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ass1P16460 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ass1P16460 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ass1P16460 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ass1P16460 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ass1P16460 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ass1P16460 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ass1P16460 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ass1P16460 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ass1P16460 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ass1P16460 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ass1P16460 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ass1P16460 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ass1P16460 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ass1P16460 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ass1P16460 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ass1P16460 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ass1P16460 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ass1P16460 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ass1P16460 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ass1P16460 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ass1P16460 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ass1P16460 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ass1P16460 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ass1P16460 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ass1P16460 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ass1P16460 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ass1P16460 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ass1P16460 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ass1P16460 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ass1P16460 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ass1P16460 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ass1P16460 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ass1P16460 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ass1P16460 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms