Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fgfr1P16092 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fgfr1P16092 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgfr1P16092 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1P16092 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1P16092 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1P16092 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms