Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp53P15975 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp53P15975 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp53P15975 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp53P15975 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp53P15975 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp53P15975 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms