Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrphP15331 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrphP15331 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrphP15331 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrphP15331 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrphP15331 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrphP15331 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PrphP15331 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrphP15331 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrphP15331 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrphP15331 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrphP15331 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrphP15331 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrphP15331 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrphP15331 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrphP15331 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrphP15331 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrphP15331 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrphP15331 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrphP15331 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrphP15331 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrphP15331 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrphP15331 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrphP15331 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrphP15331 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrphP15331 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrphP15331 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrphP15331 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrphP15331 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrphP15331 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrphP15331 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrphP15331 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PrphP15331 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrphP15331 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrphP15331 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PrphP15331 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PrphP15331 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrphP15331 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrphP15331 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrphP15331 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrphP15331 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrphP15331 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrphP15331 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrphP15331 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrphP15331 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PrphP15331 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrphP15331 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrphP15331 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrphP15331 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrphP15331 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PrphP15331 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrphP15331 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrphP15331 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PrphP15331 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrphP15331 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrphP15331 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrphP15331 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrphP15331 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrphP15331 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PrphP15331 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrphP15331 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PrphP15331 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrphP15331 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PrphP15331 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrphP15331 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrphP15331 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrphP15331 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrphP15331 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrphP15331 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PrphP15331 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrphP15331 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PrphP15331 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrphP15331 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PrphP15331 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrphP15331 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrphP15331 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrphP15331 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrphP15331 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PrphP15331 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrphP15331 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrphP15331 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrphP15331 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrphP15331 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PrphP15331 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrphP15331 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrphP15331 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrphP15331 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrphP15331 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrphP15331 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrphP15331 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrphP15331 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrphP15331 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrphP15331 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrphP15331 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PrphP15331 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrphP15331 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrphP15331 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrphP15331 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrphP15331 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PrphP15331 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms