Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms