Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl1P12850 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms