Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr4a1P12813 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms