Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctla2aP12399 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctla2aP12399 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctla2aP12399 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctla2aP12399 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctla2aP12399 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctla2aP12399 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctla2aP12399 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctla2aP12399 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctla2aP12399 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctla2aP12399 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctla2aP12399 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctla2aP12399 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctla2aP12399 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctla2aP12399 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctla2aP12399 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctla2aP12399 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctla2aP12399 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctla2aP12399 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctla2aP12399 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctla2aP12399 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctla2aP12399 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctla2aP12399 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctla2aP12399 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctla2aP12399 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctla2aP12399 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctla2aP12399 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctla2aP12399 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctla2aP12399 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctla2aP12399 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms