Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd4P10628 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms