Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl2P10148 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl2P10148 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms