Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms