Protein–RNA interactions for Protein: P0C7N9

Psmg4, Proteasome assembly chaperone 4, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg4P0C7N9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg4P0C7N9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmg4P0C7N9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms