Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms