Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxb7P09024 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxb7P09024 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms