Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms