Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NeflP08551 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NeflP08551 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NeflP08551 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NeflP08551 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NeflP08551 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NeflP08551 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NeflP08551 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NeflP08551 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NeflP08551 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NeflP08551 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NeflP08551 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NeflP08551 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NeflP08551 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NeflP08551 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NeflP08551 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NeflP08551 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NeflP08551 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NeflP08551 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NeflP08551 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NeflP08551 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NeflP08551 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NeflP08551 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NeflP08551 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NeflP08551 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NeflP08551 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NeflP08551 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NeflP08551 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NeflP08551 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NeflP08551 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NeflP08551 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NeflP08551 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NeflP08551 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NeflP08551 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NeflP08551 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NeflP08551 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NeflP08551 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NeflP08551 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NeflP08551 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NeflP08551 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NeflP08551 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NeflP08551 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NeflP08551 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NeflP08551 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NeflP08551 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NeflP08551 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NeflP08551 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NeflP08551 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NeflP08551 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NeflP08551 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NeflP08551 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NeflP08551 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NeflP08551 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NeflP08551 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NeflP08551 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NeflP08551 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NeflP08551 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NeflP08551 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NeflP08551 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NeflP08551 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NeflP08551 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NeflP08551 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NeflP08551 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NeflP08551 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NeflP08551 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NeflP08551 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NeflP08551 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NeflP08551 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NeflP08551 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NeflP08551 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NeflP08551 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NeflP08551 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NeflP08551 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NeflP08551 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NeflP08551 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NeflP08551 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NeflP08551 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NeflP08551 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NeflP08551 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NeflP08551 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NeflP08551 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NeflP08551 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NeflP08551 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NeflP08551 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NeflP08551 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NeflP08551 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NeflP08551 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NeflP08551 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NeflP08551 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NeflP08551 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NeflP08551 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NeflP08551 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NeflP08551 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NeflP08551 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NeflP08551 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NeflP08551 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NeflP08551 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NeflP08551 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NeflP08551 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NeflP08551 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms