Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms