Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TnfP06804 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TnfP06804 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TnfP06804 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TnfP06804 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TnfP06804 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TnfP06804 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TnfP06804 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TnfP06804 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TnfP06804 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TnfP06804 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TnfP06804 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TnfP06804 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TnfP06804 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TnfP06804 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TnfP06804 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TnfP06804 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TnfP06804 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TnfP06804 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TnfP06804 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TnfP06804 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TnfP06804 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TnfP06804 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TnfP06804 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TnfP06804 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TnfP06804 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TnfP06804 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TnfP06804 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TnfP06804 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TnfP06804 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TnfP06804 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TnfP06804 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TnfP06804 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TnfP06804 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TnfP06804 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TnfP06804 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TnfP06804 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TnfP06804 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TnfP06804 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TnfP06804 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TnfP06804 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TnfP06804 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TnfP06804 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TnfP06804 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TnfP06804 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TnfP06804 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TnfP06804 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TnfP06804 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TnfP06804 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TnfP06804 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TnfP06804 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TnfP06804 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TnfP06804 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TnfP06804 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TnfP06804 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TnfP06804 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TnfP06804 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TnfP06804 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TnfP06804 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TnfP06804 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TnfP06804 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TnfP06804 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TnfP06804 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TnfP06804 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TnfP06804 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TnfP06804 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TnfP06804 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TnfP06804 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TnfP06804 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TnfP06804 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TnfP06804 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TnfP06804 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TnfP06804 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TnfP06804 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TnfP06804 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TnfP06804 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TnfP06804 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TnfP06804 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TnfP06804 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TnfP06804 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TnfP06804 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TnfP06804 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TnfP06804 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TnfP06804 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TnfP06804 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TnfP06804 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TnfP06804 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TnfP06804 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TnfP06804 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TnfP06804 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TnfP06804 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TnfP06804 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TnfP06804 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TnfP06804 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TnfP06804 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TnfP06804 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TnfP06804 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TnfP06804 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TnfP06804 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TnfP06804 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms