Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06335 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06335 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06335 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P06335 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06335 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06335 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06335 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06335 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06335 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06335 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P06335 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06335 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06335 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06335 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06335 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06335 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06335 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06335 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06335 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P06335 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06335 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06335 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06335 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06335 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06335 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06335 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06335 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06335 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06335 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06335 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06335 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06335 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06335 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06335 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06335 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06335 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06335 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06335 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06335 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06335 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06335 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06335 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P06335 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P06335 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P06335 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06335 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06335 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06335 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06335 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06335 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06335 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06335 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06335 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06335 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06335 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06335 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06335 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06335 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06335 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P06335 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06335 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06335 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06335 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06335 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06335 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06335 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06335 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06335 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06335 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06335 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06335 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06335 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06335 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06335 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06335 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06335 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06335 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06335 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06335 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06335 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms