Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Got1P05201 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Got1P05201 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Got1P05201 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Got1P05201 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Got1P05201 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Got1P05201 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Got1P05201 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Got1P05201 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Got1P05201 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Got1P05201 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Got1P05201 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Got1P05201 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Got1P05201 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Got1P05201 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Got1P05201 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Got1P05201 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Got1P05201 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Got1P05201 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Got1P05201 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Got1P05201 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Got1P05201 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Got1P05201 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Got1P05201 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Got1P05201 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Got1P05201 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Got1P05201 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Got1P05201 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Got1P05201 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Got1P05201 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Got1P05201 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Got1P05201 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Got1P05201 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Got1P05201 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Got1P05201 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Got1P05201 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Got1P05201 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Got1P05201 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Got1P05201 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Got1P05201 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Got1P05201 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Got1P05201 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Got1P05201 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Got1P05201 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Got1P05201 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Got1P05201 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Got1P05201 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Got1P05201 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Got1P05201 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Got1P05201 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Got1P05201 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Got1P05201 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Got1P05201 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Got1P05201 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Got1P05201 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Got1P05201 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Got1P05201 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Got1P05201 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Got1P05201 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Got1P05201 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Got1P05201 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Got1P05201 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Got1P05201 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Got1P05201 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Got1P05201 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Got1P05201 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Got1P05201 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Got1P05201 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Got1P05201 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Got1P05201 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Got1P05201 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Got1P05201 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Got1P05201 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Got1P05201 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.6 ms