Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Ab1P01921 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-Ab1P01921 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-Ab1P01921 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms