Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2-K1P01901 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms