Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01853 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01853 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01853 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01853 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01853 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01853 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01853 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01853 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01853 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01853 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01853 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01853 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01853 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01853 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01853 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01853 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01853 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01853 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01853 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01853 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01853 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01853 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01853 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01853 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01853 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01853 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01853 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01853 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01853 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01853 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01853 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01853 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01853 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01853 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01853 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01853 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01853 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01853 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01853 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01853 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01853 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01853 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01853 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01853 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01853 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01853 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01853 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01853 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01853 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01853 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01853 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01853 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01853 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01853 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01853 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01853 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01853 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01853 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01853 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01853 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01853 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01853 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01853 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01853 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01853 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01853 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01853 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01853 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01853 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01853 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01853 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01853 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01853 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01853 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01853 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01853 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01853 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01853 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01853 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms