Protein–RNA interactions for Protein: P01845

Iglc3, Ig lambda-3 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iglc3P01845 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Iglc3P01845 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms