Protein–RNA interactions for Protein: P01812

Ig heavy chain V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01812 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01812 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01812 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01812 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01812 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01812 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01812 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01812 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01812 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01812 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01812 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01812 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01812 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01812 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01812 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01812 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01812 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01812 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01812 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01812 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01812 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01812 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01812 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01812 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01812 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01812 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01812 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01812 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01812 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01812 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01812 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01812 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01812 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01812 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01812 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01812 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01812 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01812 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01812 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01812 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01812 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01812 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01812 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01812 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01812 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01812 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01812 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01812 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01812 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01812 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01812 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01812 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01812 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01812 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01812 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01812 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01812 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01812 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01812 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01812 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01812 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01812 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01812 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01812 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01812 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01812 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01812 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01812 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01812 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01812 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01812 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01812 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01812 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01812 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01812 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01812 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01812 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01812 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01812 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01812 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01812 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01812 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01812 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01812 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01812 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01812 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01812 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01812 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01812 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01812 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01812 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
P01812 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01812 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01812 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01812 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01812 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01812 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01812 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01812 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01812 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms