Protein–RNA interactions for Protein: P01795

Ig heavy chain V region M167, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01795 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01795 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01795 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01795 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01795 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01795 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01795 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01795 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01795 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01795 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01795 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01795 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01795 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01795 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01795 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01795 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01795 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01795 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01795 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01795 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01795 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01795 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01795 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01795 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01795 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01795 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01795 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01795 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01795 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01795 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01795 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01795 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01795 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01795 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01795 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01795 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01795 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01795 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01795 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01795 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01795 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01795 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01795 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01795 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P01795 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P01795 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01795 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01795 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01795 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01795 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01795 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01795 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01795 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01795 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01795 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01795 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01795 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
P01795 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01795 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01795 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01795 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01795 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01795 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01795 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01795 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01795 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01795 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01795 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01795 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01795 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01795 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01795 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01795 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01795 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01795 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01795 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01795 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01795 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01795 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01795 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01795 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01795 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01795 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01795 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01795 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01795 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P01795 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01795 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01795 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
P01795 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01795 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01795 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01795 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01795 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01795 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01795 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01795 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01795 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01795 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01795 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms