Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01748 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01748 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01748 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01748 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01748 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01748 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01748 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01748 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01748 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01748 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01748 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01748 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01748 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01748 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01748 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01748 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01748 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01748 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01748 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01748 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01748 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01748 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01748 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01748 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01748 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01748 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01748 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01748 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01748 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01748 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01748 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01748 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01748 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01748 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01748 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01748 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01748 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01748 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01748 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01748 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01748 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01748 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01748 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01748 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01748 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01748 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01748 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01748 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01748 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01748 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01748 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01748 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01748 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01748 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01748 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01748 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01748 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01748 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01748 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01748 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01748 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01748 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01748 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01748 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01748 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01748 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01748 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01748 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01748 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01748 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01748 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01748 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01748 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01748 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01748 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
P01748 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01748 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01748 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01748 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01748 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01748 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01748 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01748 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01748 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01748 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01748 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01748 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01748 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01748 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01748 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01748 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01748 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01748 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01748 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01748 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01748 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01748 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01748 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01748 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms