Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01741 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01741 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01741 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01741 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01741 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01741 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01741 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01741 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01741 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01741 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01741 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01741 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01741 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01741 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01741 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01741 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01741 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01741 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01741 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01741 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01741 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01741 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01741 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01741 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01741 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01741 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01741 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01741 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01741 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01741 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01741 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01741 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01741 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01741 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01741 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01741 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01741 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01741 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01741 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01741 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01741 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01741 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01741 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01741 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01741 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01741 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01741 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01741 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01741 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01741 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01741 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01741 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01741 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01741 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01741 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01741 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01741 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01741 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01741 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01741 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01741 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01741 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01741 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01741 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01741 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01741 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01741 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01741 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01741 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01741 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01741 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01741 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01741 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01741 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01741 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01741 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01741 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01741 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01741 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01741 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01741 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01741 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01741 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01741 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01741 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01741 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01741 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01741 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01741 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01741 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01741 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01741 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01741 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01741 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01741 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01741 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01741 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01741 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01741 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms