Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01728 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01728 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01728 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01728 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01728 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01728 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01728 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01728 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01728 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01728 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01728 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01728 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01728 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01728 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01728 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01728 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01728 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01728 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01728 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01728 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01728 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01728 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01728 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01728 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01728 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01728 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01728 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01728 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01728 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01728 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01728 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01728 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01728 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01728 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01728 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01728 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01728 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01728 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01728 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01728 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01728 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01728 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01728 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01728 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01728 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01728 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01728 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01728 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01728 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01728 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01728 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01728 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01728 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01728 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01728 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01728 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01728 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01728 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01728 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01728 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01728 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01728 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01728 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01728 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01728 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01728 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01728 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01728 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01728 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01728 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01728 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01728 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01728 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01728 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01728 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01728 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01728 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01728 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms