Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Apaf1O88879 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms