Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hcn2O88703 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms