Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmx1bO88609 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmx1bO88609 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms