Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn2O88552 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn2O88552 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms