Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfrO88507 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfrO88507 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfrO88507 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfrO88507 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfrO88507 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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