Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms