Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cfdp1O88271 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cfdp1O88271 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfdp1O88271 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms