Protein–RNA interactions for Protein: O88253

Gm10226, Mszf39 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10226O88253 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10226O88253 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms