Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CaskO70589 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CaskO70589 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CaskO70589 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CaskO70589 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CaskO70589 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CaskO70589 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CaskO70589 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CaskO70589 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CaskO70589 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CaskO70589 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CaskO70589 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CaskO70589 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CaskO70589 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CaskO70589 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CaskO70589 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CaskO70589 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CaskO70589 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CaskO70589 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CaskO70589 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CaskO70589 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CaskO70589 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CaskO70589 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CaskO70589 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CaskO70589 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CaskO70589 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CaskO70589 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CaskO70589 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CaskO70589 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CaskO70589 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CaskO70589 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CaskO70589 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CaskO70589 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CaskO70589 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CaskO70589 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CaskO70589 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CaskO70589 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CaskO70589 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CaskO70589 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CaskO70589 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CaskO70589 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CaskO70589 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CaskO70589 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CaskO70589 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CaskO70589 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CaskO70589 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CaskO70589 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CaskO70589 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CaskO70589 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CaskO70589 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CaskO70589 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CaskO70589 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CaskO70589 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CaskO70589 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CaskO70589 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CaskO70589 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CaskO70589 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CaskO70589 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CaskO70589 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CaskO70589 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CaskO70589 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CaskO70589 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CaskO70589 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CaskO70589 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CaskO70589 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CaskO70589 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CaskO70589 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CaskO70589 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CaskO70589 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CaskO70589 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CaskO70589 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CaskO70589 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CaskO70589 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CaskO70589 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CaskO70589 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CaskO70589 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CaskO70589 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CaskO70589 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms