Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psma3O70435 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psma3O70435 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psma3O70435 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psma3O70435 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psma3O70435 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma3O70435 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma3O70435 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma3O70435 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma3O70435 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma3O70435 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma3O70435 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma3O70435 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma3O70435 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma3O70435 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma3O70435 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Psma3O70435 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma3O70435 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma3O70435 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma3O70435 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma3O70435 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma3O70435 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma3O70435 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma3O70435 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psma3O70435 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma3O70435 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma3O70435 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms