Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtssO70370 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtssO70370 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtssO70370 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtssO70370 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtssO70370 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtssO70370 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtssO70370 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtssO70370 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtssO70370 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtssO70370 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtssO70370 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtssO70370 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CtssO70370 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtssO70370 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtssO70370 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtssO70370 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtssO70370 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtssO70370 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtssO70370 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CtssO70370 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtssO70370 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtssO70370 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtssO70370 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtssO70370 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtssO70370 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtssO70370 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtssO70370 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtssO70370 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtssO70370 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtssO70370 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtssO70370 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtssO70370 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtssO70370 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtssO70370 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtssO70370 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtssO70370 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CtssO70370 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtssO70370 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtssO70370 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtssO70370 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtssO70370 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtssO70370 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtssO70370 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtssO70370 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtssO70370 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtssO70370 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CtssO70370 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtssO70370 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtssO70370 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CtssO70370 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtssO70370 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtssO70370 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtssO70370 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtssO70370 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtssO70370 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtssO70370 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtssO70370 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtssO70370 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtssO70370 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtssO70370 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtssO70370 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtssO70370 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtssO70370 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtssO70370 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtssO70370 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtssO70370 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtssO70370 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtssO70370 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtssO70370 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtssO70370 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtssO70370 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtssO70370 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtssO70370 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtssO70370 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtssO70370 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtssO70370 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtssO70370 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtssO70370 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtssO70370 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtssO70370 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtssO70370 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtssO70370 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtssO70370 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtssO70370 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtssO70370 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtssO70370 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CtssO70370 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtssO70370 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtssO70370 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtssO70370 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtssO70370 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtssO70370 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtssO70370 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtssO70370 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtssO70370 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtssO70370 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtssO70370 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtssO70370 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtssO70370 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms