Protein–RNA interactions for Protein: O70338

Rnaseh1, Ribonuclease H1, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh1O70338 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnaseh1O70338 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnaseh1O70338 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms