Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb5O70309 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms