Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chrna4O70174 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrna4O70174 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chrna4O70174 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms